يُعدّ المجلس كيانًا غير ربحي ومجلسًا تخصصيًا يعمل تحت إشراف مجلس الجمعيات الأهلية، ويُعنى بتمثيل جمعيات الأيتام في المملكة وتمكينها وتعزيز التكامل والتنسيق فيما بينها، وقد انطلقت نواته الأولى عام 1438هـ بوصفه لجنةً تنسيقية تجمع الجهات العاملة في قطاع رعاية الأيتام، ثم صدر قرار وزارة الموارد البشرية والتنمية الاجتماعية رقم (203520/5) بتاريخ 13/11/1440هـ بتأسيس المجلس رسميًا، ليواصل دوره في دعم القطاع وتمكينه، وقد ترأس مجلس إدارته في دورتيه الأولى والثانية معالي الدكتور عبد الرحمن بن عبد العزيز السويلم – رحمه الله – ثم تولّى رئاسة المجلس بعده الدكتور يوسف بن عبدالله الحازمي.
ويؤدي المجلس دورًا محوريًا في توحيد الجهود وتعزيز الشراكات وتطوير قطاع وجمعيات الأيتام، التي يزيد عددها اليوم على (150) جمعية منتشرة في مختلف مناطق المملكة، وتخدم أكثر من (200) ألف مستفيد، وقد أطلق المجلس منذ تأسيسه العديد من المبادرات والبرامج النوعية الهادفة إلى رفع كفاءة الجمعيات ومنسوبيها ومستفيديها وتمكينهم مؤسسيًا وتنمويًا، بما يسهم في تعزيز أثرها الاجتماعي وتحقيق مستهدفات رؤية المملكة 2030، نحو قطاع متكامل يستهدف استدامة الموارد وتعظيم الأثر الاجتماعي.